轮状病毒胃肠炎（Rotavirus Gastroenteritis, RVGE）在COVID-19大流行期间全球范围内显著下降，日本北海道县自2020年起连续5年维持极低活动水平。北海道自2019年7月启动的医院监测首次记录到2025年轮状病毒胃肠炎的回升。研究人员通过分析住院儿童的时序变化、年龄分布及病毒基因型特征，对该次回升进行表征。在完整观测期（2019年7月至2025年10月）共记录113例住院病例，其中49例发生于2025年1—10月，而2020—2024年几乎无病例。全基因组测序显示，此次流行以马样G3P[8]和G8P[8]毒株为主，这些毒株与当前国际流行谱系密切相关，且与既往本地检测株存在显著遗传差异。年龄分布发生显著偏移：常规疫苗接种引入前（2019年7月—2020年9月），0–1岁儿童占病例的40.9%，但在2025年该年龄段无病例；而7–12岁组占比从13.6%升至51.0%。结果表明婴儿仍受疫苗良好保护，但大流行期间病毒传播减少及大龄儿童免疫力下降促使病毒重新出现。持续的基因组与流行病学监测对于追踪轮状病毒演化及评估后疫情时代疫苗影响至关重要。
该研究发表于《Journal of Medical Virology》，针对日本北海道县在COVID-19大流行后轮状病毒胃肠炎（Rotavirus Gastroenteritis, RVGE）活动长期低迷并于2025年出现回升的现象展开系统调查。研究背景方面，A组轮状病毒（Group A Rotaviruses, RVAs）是全球婴幼儿及多种动物严重腹泻的主要病原，其基因组分型多归属于Wa样或DS-1样基因型组合。日本自2011—2012年先后引入Rotarix与RotaTeq疫苗，2020年10月纳入国家免疫规划后覆盖率达93.6%，结合COVID-19防控非药物干预措施，导致北海道连续五年几乎无季节性流行。随着防控措施逐步放松，其他国家已报告病毒活动回升，但北海道此前仍维持低水平，因此明确2025年首次回升的流行病学与病毒学特征具有重要公共卫生意义。
研究人员依托覆盖北海道18家医院的多中心住院监测体系，纳入2019年7月—2025年10月间0–15岁实验室确诊RVGE住院病例，结合全基因组测序（Whole-Genome Sequencing, WGS）与系统发育分析，比较疫苗接种前后年龄分布变化，并对主要抗原表位进行氨基酸差异分析，以揭示毒株来源、演化关系及疫苗保护情况。
关键技术方法方面，研究基于多中心住院队列，采用快速抗原检测或多重聚合酶链反应（Polymerase Chain Reaction, PCR）确诊病例，提取粪便标本病毒RNA后进行二代测序（Next-Generation Sequencing, NGS），利用Rotavirus A基因型判定工具完成11个基因节段的基因分型，并通过最大似然法构建系统发育树，同时采用统计学方法比较不同年龄组分布差异，分析VP7与VP4抗原表位与疫苗株的氨基酸差异。
研究结果分为以下部分：
3.1 住院患者趋势 ：2019年下半年记录33例，2020年仅11例，2021年为零，2022—2024年维持在个位数，2025年1月起病例快速上升，第15周达峰值（8例），此后下降，全年累计49例。
3.2 住院患者年龄分布 ：疫苗接种前0–1岁占40.9%，2025年该组无病例，7–12岁组从13.6%增至51.0%，统计学差异显著。
3.3 2025年住院患者临床特征 ：中位年龄7岁，男性占51.0%，病例集中在札幌、室兰、钏路等地，71.4%无疫苗接种史，28.6%曾接种Rotarix或RotaTeq。
3.4 全基因组分析 ：共获得30株完整基因型，包括马样G3P[8]（DS-1样，占60.0%）、典型人G3P[8]（Wa样，13.3%）和G8P[8]（DS-1样，26.7%），不同基因型呈地域分布差异，且与2010年代本地株遗传距离较远，而与2020年代中国、越南等地的国际流行株高度相似。
3.5 系统发育分析 ：VP7（G3/G8）和VP4（P[8]）均聚类于当前国际流行分支，与旧株遗传距离较大。
3.6 VP7与VP4抗原表位氨基酸差异 ：2025年分离株与Rotarix和RotaTeq在多个表位存在氨基酸差异，但不足以单独解释疫苗突破感染现象。
讨论部分指出，本次回升由多种基因型共同引起，可能源于国际输入并在低暴露与免疫力下降背景下扩散。婴儿因高疫苗覆盖率得到保护，而大龄儿童因自然暴露减少导致易感积累。尽管出现突破性感染，疫苗仍有效抑制总体流行规模。研究局限性包括缺乏检测总量数据、部分标本缺失及抗原检测灵敏度限制。结论强调，北海道在五年低活动后出现轮状病毒回升，主要流行株为与亚洲近期谱系密切相关的马样G3P[8]及G8P[8]，疫苗对婴幼儿保护效果显著，持续监测对评估后疫情时代病毒演化与疫苗影响至关重要。
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