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摘要芝麻（Sesamum indicum L.）是一种具有商业价值的油料作物，其在育种中的有效利用依赖于对其遗传多样性的深入理解。本研究利用表达序列标签-简单序列重复（EST-SSR）标记和定量形态特征，在两个季风/秋季（2023年和2024年）对177份芝麻材料（107份本地育
芝麻（Sesamum indicum L.）是一种具有商业价值的油料作物，其在育种中的有效利用依赖于对其遗传多样性的深入理解。本研究利用表达序列标签-简单序列重复（EST-SSR）标记和定量形态特征，在两个季风/秋季（2023年和2024年）对177份芝麻材料（107份本地育种系、46份外来育种系和24个已发布的栽培品种）进行了分子和表型多样性评估。通过对96个EST-SSR标记的筛选，发现了29个多态性标记，其多态性信息含量（PIC）范围从0.2888（SEM-12–58）到0.8655（ZM_5），平均值为0.6089；其中24个标记的信息量较高（PIC > 0.50），5个标记的信息量中等（0.25 < PIC ≤ 0.50）。分子方差分析显示，95%的遗传变异存在于种群内部，仅有5%存在于种群之间（Φst = 0.048, P < 0.001），这一结果得到了香农多样性分析（种群内部95.79%）和高重叠值（D' = 0.910）的独立支持，表明各种群之间存在广泛的等位基因共享。本地育种系的等位基因丰富度相对较高（Na = 7.069; I = 1.323），并且在样本量标准化为n = 24后这一排名仍然保持一致，证实这种优势反映了真正的遗传丰富度，而不仅仅是采样深度的结果。基于最佳线性无偏估计（BLUEs）调整后的性状均值的排列多元方差分析（PERMANOVA）表明，92.21%的表型变异存在于种群内部；已发布的栽培品种表现出最高的产量-性状均值，这是定向选择的可预测结果。主坐标分析（PCoA）、贝叶斯聚类（K = 2; ΔK = 298.489）和未加权对组平均法（UPGMA）分析均表明这三个群体之间存在广泛的遗传混合。这些发现证明了EST-SSR标记在芝麻种质资源鉴定中的实用性，并突显了其在未来育种计划中整合的丰富遗传潜力。
芝麻（Sesamum indicum L.）是一种具有商业价值的油料作物，其在育种中的有效利用依赖于对其遗传多样性的深入理解。本研究利用表达序列标签-简单序列重复（EST-SSR）标记和定量形态特征，在两个季风/秋季（2023年和2024年）对177份芝麻材料（107份本地育种系、46份外来育种系和24个已发布的栽培品种）进行了分子和表型多样性评估。通过对96个EST-SSR标记的筛选，发现了29个多态性标记，其多态性信息含量（PIC）范围从0.2888（SEM-12–58）到0.8655（ZM_5），平均值为0.6089；其中24个标记的信息量较高（PIC > 0.50），5个标记的信息量中等（0.25 < PIC ≤ 0.50）。分子方差分析显示，95%的遗传变异存在于种群内部，仅有5%存在于种群之间（Φst = 0.048, P < 0.001），这一结果得到了香农多样性分析（种群内部95.79%）和高重叠值（D' = 0.910）的独立支持，表明各种群之间存在广泛的等位基因共享。本地育种系的等位基因丰富度相对较高（Na = 7.069; I = 1.323），并且在样本量标准化为n = 24后这一排名仍然保持一致，证实这种优势反映了真正的遗传丰富度，而不仅仅是采样深度的结果。基于最佳线性无偏估计（BLUEs）调整后的性状均值的排列多元方差分析（PERMANOVA）表明，92.21%的表型变异存在于种群内部；已发布的栽培品种表现出最高的产量-性状均值，这是定向选择的可预测结果。主坐标分析（PCoA）、贝叶斯聚类（K = 2; ΔK = 298.489）和未加权对组平均法（UPGMA）分析均表明这三个群体之间存在广泛的遗传混合。这些发现证明了EST-SSR标记在芝麻种质资源鉴定中的实用性，并突显了其在未来育种计划中整合的丰富遗传潜力。
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