改进的新抗原性检测方法能够捕捉原发性黑色素瘤各亚型中独特的肿瘤-免疫相互作用

摘要

背景

随着免疫检查点抑制剂疗法逐渐应用于临床高风险的原发性黑色素瘤治疗，人们越来越需要清晰地了解不同原发性黑色素瘤亚型之间的肿瘤-免疫相互作用。肿瘤的基因组特性在其与免疫系统的相互作用中起着关键作用，这一领域在转移性黑色素瘤中已得到广泛研究，但在原发性黑色素瘤亚型中的研究相对较少。持续存在的肿瘤突变负担（pTMB）被提出作为转移性黑色素瘤中新抗原性的一个更有效的指标，但其在本病中的作用尚不清楚。

方法

本研究利用了178例主要为原发性黑色素瘤的病例（皮肤非肢端型：69例，肢端型：36例，黏膜型：73例），这些病例均进行了全基因组测序（WGS，127例），以检测TMB、pTMB、非整倍体及杂合性丢失情况，并通过多重免疫组化（mIHC，140例）来识别肿瘤内的T细胞（CD3+、CD8+、CD45RO+和CD103+）、B细胞（CD20+）、树突状细胞（CD11c+）和PD-L1+细胞。

结果

虽然pTMB主要由原发性黑色素瘤亚型中存在的多个拷贝突变贡献，但某些克隆性的pTMB类型与CD8+ T细胞和CD8+ CD103+ T细胞之间存在特定关系，而这些关系无法通过传统的克隆性TMB检测方法发现。在皮肤黑色素瘤中，克隆性单拷贝pTMB与CD8+ T细胞（p=0.003）和CD8+ CD103+ T细胞浸润的增加呈正相关（p=0.008）。相比之下，在肢端型和黏膜型黑色素瘤中，克隆性多拷贝pTMB与CD8+ CD103+ T细胞浸润的增加呈正相关（p=0.048和p=0.049）。皮肤原发性黑色素瘤中的CD8+ T细胞和CD8+ CD103+ T细胞比例高于黏膜型黑色素瘤（p=0.009和p=0.0002）。此外，在皮肤黑色素瘤中，CD8+ T细胞浸润与无淋巴管侵袭相关（p=0.003），并与肿瘤有丝分裂率呈负相关（p=0.049），这表明这类疾病的侵袭性较低。

结论

不同原发性黑色素瘤亚型在免疫和基因组特征及其相互作用方面存在显著差异。与传统的TMB指标相比，不同的pTMB测量方法有助于更准确地识别各亚型之间的肿瘤-免疫关联。我们的研究结果表明，pTMB是原发性黑色素瘤中的一个重要新抗原性标志物，可能调节免疫细胞的浸润，从而导致疾病更具侵袭性。

背景

随着免疫检查点抑制剂疗法逐渐应用于临床高风险的原发性黑色素瘤治疗，人们越来越需要清晰地了解不同原发性黑色素瘤亚型之间的肿瘤-免疫相互作用。肿瘤的基因组特性在其与免疫系统的相互作用中起着关键作用，这一领域在转移性黑色素瘤中已得到广泛研究，但在原发性黑色素瘤亚型中的研究相对较少。持续存在的肿瘤突变负担（pTMB）被提出作为转移性黑色素瘤中新抗原性的一个更有效的指标，但其在本病中的作用尚不清楚。

方法

本研究利用了178例主要为原发性黑色素瘤的病例（皮肤非肢端型：69例，肢端型：36例，黏膜型：73例），这些病例均进行了全基因组测序（WGS，127例），以检测TMB、pTMB、非整倍体及杂合性丢失情况，并通过多重免疫组化（mIHC，140例）来识别肿瘤内的T细胞（CD3+、CD8+、CD45RO+和CD103+）、B细胞（CD20+）、树突状细胞（CD11c+）、巨噬细胞（CD68+）和PD-L1+细胞。

结果

虽然pTMB主要由原发性黑色素瘤亚型中存在的多个拷贝突变贡献，但某些克隆性的pTMB类型与CD8+ T细胞和CD8+ CD103+ T细胞之间存在特定关系，而这些关系无法通过传统的克隆性TMB检测方法发现。在皮肤黑色素瘤中，克隆性单拷贝pTMB与CD8+ T细胞（p=0.003）和CD8+ CD103+ T细胞浸润的增加呈正相关（p=0.008）。相比之下，在肢端型和黏膜型黑色素瘤中，克隆性多拷贝pTMB与CD8+ CD103+ T细胞浸润的增加呈正相关（p=0.048和p=0.049）。皮肤原发性黑色素瘤中的CD8+ T细胞和CD8+ CD103+ T细胞比例高于黏膜型黑色素瘤（p=0.009和p=0.0002）。此外，在皮肤黑色素瘤中，CD8+ T细胞浸润与无淋巴管侵袭相关（p=0.003），并与肿瘤有丝分裂率呈负相关（p=0.049），这表明这类疾病的侵袭性较低。

结论

不同原发性黑色素瘤亚型在免疫和基因组特征及其相互作用方面存在显著差异。与传统的TMB指标相比，不同的pTMB测量方法有助于更准确地识别各亚型之间的肿瘤-免疫关联。我们的研究结果表明，pTMB是原发性黑色素瘤中的一个重要新抗原性标志物，可能调节免疫细胞的浸润，从而导致疾病更具侵袭性。