基于活性筛选的碱基编辑器突变扫描增强策略

时间:2025年10月15日
来源:Nature Genetics

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本研究针对碱基编辑器筛选中存在的高比例未编辑细胞(>40%)导致结果噪声显著的问题,开发了基于剪接的共筛选方法,通过富集高编辑活性细胞将未编辑细胞比例降至10%以下,显著提升TP53等靶点突变功能解析的精准度,为疾病机制研究和药物开发提供关键技术支撑。

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碱基编辑器(Base Editor)作为CRISPR技术的重要分支,能够实现基因组核苷酸水平的高通量功能解析,这对理解人类疾病遗传基础和推动治疗开发至关重要。然而,细胞间编辑效率的显著差异性会引入干扰噪声,可能掩盖关键生物学结果。本研究开发了一种协同筛选策略,通过富集具有高碱基编辑活性的细胞群体,显著提升目标基因位点的编辑效率。研究人员以TP53基因为模型,通过向导RNA(gRNA)的梯度覆盖实验,验证了这种活性导向筛选方法相较于传统筛选方案的优势——能更精准地识别特定突变及功能性蛋白结构域。这种模块化筛选策略有望在多类应用场景中提升碱基编辑器扫描的分辨率。

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