核纤层蛋白A/C通过调控半胱氨酸代谢流重编程表观基因组决定干细胞命运与衰老进程

时间:2026年1月29日
来源:Nature Metabolism

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本综述揭示了核纤层蛋白A/C作为半胱氨酸分解代谢流的关键调控因子,通过影响组蛋白乙酰化(H3K9ac/H3K27ac)和甲基化(H3K9me3)平衡,在干细胞多能性状态转换、细胞命运决定及早衰综合征(如HGPS)中发挥核心作用。研究发现,Lamin A/C缺失或突变(如p.G609G)会分别上调或下调胱硫醚γ-裂解酶(CTH)和胱硫醚β-合酶(CBS)表达,改变细胞内半胱氨酸代谢流向乙酰辅酶A(acetyl-CoA)或S-腺苷甲硫氨酸(SAM)的转化,进而通过调控SP1转录因子活性及PRC2复合物介导的染色质重塑,影响胚胎发育、心脏分化及基因组稳定性。靶向干预CTH/CBS或限制甲硫氨酸摄入可逆转上述表型,为治疗核纤层蛋白病提供了新靶点。

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核纤层蛋白A/C通过调控半胱氨酸代谢流决定细胞命运
Lamin A/C抑制naive多能干细胞中半胱氨酸的生物合成与分解代谢
研究首次发现,核纤层蛋白A/C(Lamin A/C)在naive多能干细胞中通过抑制胱硫醚γ-裂解酶(CTH)和胱硫醚β-合酶(CBS)的表达,负调控半胱氨酸代谢流。在Lmna-/-小鼠胚胎干细胞(mES细胞)中,CTH和CBS的表达显著上调,导致细胞内半胱氨酸、丙酮酸和乙酰辅酶A(acetyl-CoA)水平升高。机制上,Lamin A/C通过招募PRC2复合物在CthCbs启动子区域沉积H3K27me3抑制性标记,限制转录因子SP1的结合;而Lmna缺失后,SP1结合增加,驱动CTH/CBS转录。相反,在模拟早衰综合征的Lmnap.G609G突变mES细胞中,CTH和CBS表达被抑制,半胱氨酸代谢流向SAM合成增强,导致H3K9me3水平升高。
半胱氨酸作为组蛋白H3K9和H3K27乙酰化的主要碳源
同位素示踪实验(13C3-L-半胱氨酸)证实,在Lmna-/-mES细胞中,半胱氨酸衍生的碳原子优先掺入组蛋白H3K9和H3K27的乙酰化位点(H3K9ac/H3K27ac),而在野生型细胞中仅少量标记。这种代谢重塑直接导致染色质开放性增加,特别是位于非核纤层相关域(non-LADs)的基因启动子区域乙酰化水平升高。抑制CTH或CBS可逆转Lmna缺失引起的H3K9ac/H3K27ac异常升高,而过表达CTH/CBS则模拟该表型。
从naive到primed多能性状态的转变伴随Lamin A/C下调及CTH/CBS激活
在胚胎发育过程中,植入前(E3.5)到植入后(E5.5)胚胎的过渡阶段,Lamin A/C表达显著降低,而CTH和CBS表达急剧上升。体外实验显示,naive mES细胞向primed状态转化时,Lamin A/C水平下降,CTH/CBS上调,驱动组蛋白乙酰化增加,促进多能性状态转换。在人类胚胎干细胞(hES细胞)中也观察到类似现象。功能上,敲低CthCbs可挽救Lmna-/-细胞中primed多能性标志物(如Nanoghigh)的异常表达,恢复naive细胞克隆形态。
CTH/CBS异常表达导致细胞命运决定异常
Lmna缺失促进心肌细胞过早分化和心律失常,而敲低CthCbs后可显著减少双核心肌细胞比例,改善收缩节律性。单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析进一步证实,Cth敲低可逆转Lmna-/-细胞中平滑肌细胞、心肌细胞和神经元前体细胞的比例失衡。在Lmnap.G609G mES细胞中,CTH/CBS表达下降导致H3K9me3累积、DNA损伤修复能力减弱及细胞衰老(SA-β-gal活性升高)。重新引入生理水平的CBS可降低线粒体活性氧(ROS),减轻衰老相关分泌表型(SASP)基因表达。
靶向半胱氨酸代谢通路改善早衰表型
Lmnap.G609G mES细胞中,提高培养基中半胱氨酸浓度(400 μmol·L-1)或过表达CBS,可部分恢复组蛋白乙酰化水平,挽救心肌细胞分化缺陷。动物实验表明,老年小鼠(24月龄)心肌细胞中progerin转录本增加,CBS表达下降,H3K9me3水平升高;而甲硫氨酸限制饮食可降低SAM/SAH比值,延缓衰老进程。临床样本分析显示,早衰症患者成纤维细胞中CBSmRNA水平显著低于年轻个体。
结论
本研究揭示了Lamin A/C–半胱氨酸代谢轴在调控表观基因组重编程中的核心作用:Lamin A/C通过抑制CTH/CBS表达,限制半胱氨酸流向acetyl-CoA,维持naive多能性;其缺失或突变则通过改变代谢流,破坏组蛋白修饰平衡,最终导致细胞命运异常和早衰。靶向该通路(如调控甲硫氨酸摄入或CTH/CBS活性)为治疗核纤层蛋白病及年龄相关疾病提供了新策略。

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