生命科学为IT提供新商机

时间:2002年7月12日
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[AD340X300]一个行业的科技变革是由另一行业的科技进步促成的先例在人类历史上是不常见的。但这正是今天生命科学所面临的局面。人类遗传密码图谱既是生物学的壮举也是计算的壮举。信息科技有史以来首次成为推动实验生物学发展的原动力。这一趋势明显地表现在所有与了解疾病起因、新药开发相关的关键领域中——基因组学、蛋白质组学以及代谢途径的研究等。这些专业的研究需要依靠强大的计算机系统、数据和存储管理系统来完成大量的数据处理工作。
   
    生命科学将会引起一场同工业革命和Internet同等重要的社会经济变革。IBM正力图使自己处于促使这场改革得以实现的科技领导地位。
   
    生命科学是IBM关注的系列“发展计划”中的重要一项。IBM专门成立了生命科学部门,该部门的业务分为七块:制药、农业科学、生物科技、生物信息和生物内容、政府/学术机构、装置和诊断及e-健康。据副总裁Carol Kova介绍,预计生命科学到2004年将为IBM带来超过400亿美金的市场机会。2000年8月,IBM宣布首期投资一亿美金激励生命科学部门解决方案的开发。到目前为止,这个部门已宣布与多家基因组、蛋白组研究的开拓者和生物信息学工具提供商签定了合作协议,解决他们在信息科技方面的需求。
   
    生命科学的数据量每6个月增加一倍,人类基因组数据库有大约3 terabytes的数据,或者相当于1.5亿页的信息。如果所有编码印刷在报纸上,会填满151191页纸,折叠放在报纸架上有42英尺高。这些都对计算能力提出了较高的要求。而下一步对生命与疾病的分子生物学的了解将帮助人类解开促使基因将人体内一百多万种蛋白质编码的复杂原因。对这些蛋白质的排列结构和它们之间交互关系的研究将需要前所未有的计算马力。这需要分析、分类、研究超大数量的信息并把它们同全球各地的研究中心和科学家们协调起来。
   
    据介绍,IBM正在制造一台计算速度高于今天任何一台计算机100倍的超级计算机——蓝色基因(Blue Gene)。这款计算机的设计是为通过大规模的生物分子模拟来深入了解蛋白叠加结构的构造原理。它的速度将是1997年打败卡斯帕罗夫的深蓝计算机的1000倍。1999年12月,IBM在这项五年的研究项目上投资1亿美金,以提高生物学应用的超级计算机的制造工艺。
   
    据了解,计算机系统在生命科学领域的应用主要有,高性能计算、数据集成和管理、存储管理、咨询服务、知识管理、协作技术和电子商务解决方案领域等。
   
    例如,高性能计算为客户提供处理和分析大量基因组和蛋白质数据的能力,帮助解决一些在我们的时代所面临的最复杂的医学挑战,包括癌症和心脏疾病的治疗;数据集成和管理——生命科学公司掌握的是由基因组和蛋白质研究产生的令人吃惊的海量数据。这些数据以每六个月翻一倍的速度增长。研究人员需要组织、综合来源于不同途径的、不同格式、存储在不同文件中的信息来找出基因和蛋白质之间的模式和联系。他们的发现必须在生命科学研究中实时共享信息和资源才会有科学突破。越来越多的公司使用数据整合及数据管理软件,来管理并从生命科学数据中提取价值。
   
    通过虚拟数据库,科学家们可以方便地搜寻变化多样的数据资源,像公共的和私人的数据库,以及不同的文件格式,并以一种单一格式阅读信息,不必移动数据或改变数据底层格式。举例来说,一个研究人员可以用数据库将一种目标药物与它类似的化合物做比较,同时查询内部和外部的数据资源。数据库会以一种合并、同意的格式访问和提供信息。这种独一无二的技术可以大幅度改善研究与开发周期并降低药物开发成本。
   
    IT业还可以向生命科学业提供最先进、高性能的存储系统来存放、访问和读取基因组和蛋白质组的数据。
   
    纵观人类在生命科学方面的研究,IT技术所扮演的角色是不可取代的。IBM主席和CEO郭士纳几年前在北京曾经向他的中国同事提到信息科技已深入到人们生活的每一处。他说生物科技马上就要来到了。同信息科技一起,它将改变我们的生活。对此,中国IT业者应该引起注意。
   
    摘自:科技之光

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