癌症基因：选择决定性突变

生物通报道：人类基因组测序的确定使在基因组范围内大规模筛选与癌症有关的突变变得更加简单。3月8日《Nature》杂志一篇文章报道说，Greenman等对210种人类癌症相关的518个激酶基因进行了突变分析。同期杂志中，Mullighan等以婴儿急性淋巴细胞白血病（acute lymphoblastic leukemia ，ALL）为靶标，采用相似的手段观察ALL发作时，转录和信号传递网络在B细胞发育早期的作用。

生物通报道：人类基因组测序的确定使在基因组范围内大规模筛选与癌症有关的突变变得更加简单。这种类型的筛选，最为重要的是：区分诱发癌症的司机突变（driver mutations）和癌症引起的基因组不稳定所造成的乘客突变（passenger mutations）。

3月8日《Nature》杂志一篇文章报道说，Greenman等对210种人类癌症相关的518个激酶基因进行了突变分析。同期杂志中，Mullighan等以婴儿急性淋巴细胞白血病（acute lymphoblastic leukemia ，ALL）为靶标，采用相似的手段观察ALL发作时，转录和信号传递网络在B细胞发育早期的作用。

Greenman等发现，不同的癌症样本，点突变的数目明显不同，并且原本只局限于乳腺癌的C>G颠换，在几种癌症中都存在。他们推测非同义突变（non-synonymous mutations）是选择压力的基础，因为改变了蛋白的氨基酸序列，而非同义突变比同义突变多的基因更有可能携带司机突变。Greenman等汇编了一张激酶基因的表单，并根据它们至少有一个司机突变的可能性对它们排序。研究人员发现容纳有司机突变的多重激酶的途径是N-terminal 激酶 (JNK)和纤维原细胞生长因子（fibroblast growth factor ，FGF）信号途径。

Mullighan等测量了242例ALL患者的基因型，发现40％的基因组改变发生在与早期B淋巴细胞发育有关的基因中，如早期B细胞因子和转录因子PAX5。PAX5对B细胞的作用和维护非常重要。Mullighan等发现大多数PAX5突变导致转录因子剂量略微减少，在一种B细胞祖先ALL亚型上发现的融合蛋白PAX5-ETV6，具有野生型PAX5转录活化的竞争性抑制剂的功能。他们下一步打算利用基因表达谱微列阵技术鉴别一种ALL亚型中，一组（42个基因）PAX5的活性靶标。

                     

Mullighan等正打算为鉴别无特征的癌症倾向性PAX5突变和融合蛋白设计下一代小鼠模型。研究人员对研究体内每种激酶司机突变的功能顺序充满信息，以便更广泛地在基因组范围内进行筛选，从蛋白质功能上探索肿瘤发生倾向。（生物通记者 子元）

参考：
 Greenman et al.
Patterns of somatic mutation in human cancer genomes.
Nature 446, 153-158 (8 March 2007)
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Mullighan et al.
Genome-wide analysis of genetic alterations in acute lymphoblastic leukaemia.
Nature AOP, 7 March 2007
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