RNA稳定性遗传变异调控复杂性状与疾病风险的机制解析

时间:2025年9月6日
来源:Nature Genetics

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研究人员开发了计算流程RNAtracker,通过整合代谢标记数据(Bru/BruChase-seq)和CRISPR prime编辑技术,首次系统鉴定了665个基因中5000余个等位特异性RNA稳定性(asRS)变异。这些变异富集于免疫相关通路,通过影响microRNA靶位点和RNA结合蛋白结合区调控mRNA稳定性,为解析免疫疾病风险提供了新视角。

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基因表达的精细调控不仅取决于转录过程,信使RNA(mRNA)的稳定性同样是关键因素。这项研究通过创新的计算流程RNAtracker,结合代谢标记实验(Bru/BruChase-seq)数据,成功区分了影响RNA稳定性的等位特异性变异(asRS)和影响转录的变异。在11种人类细胞系中,研究人员发现了665个基因中存在5000多个asRS变异位点。

这些变异绝非随机分布——它们精准富集在保守的microRNA靶向区域和RNA结合蛋白(RBP)的结合位点,揭示了RNA降解调控的分子机制。研究团队进一步采用大规模平行筛选技术(MapUTR)和CRISPR prime编辑,验证了这些变异确实通过调控转录后mRNA丰度影响基因表达。

特别值得注意的是,asRS相关基因在多种免疫相关通路中显著富集。这些发现为理解类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮等免疫系统疾病的遗传风险提供了全新视角。该研究突破性地将RNA稳定性这一长期被忽视的调控机制,与复杂性状和疾病风险联系起来,为精准医学开辟了新研究方向。

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