摘要7510：口腔鳞状细胞癌中外染色质DNA的分子和临床相关因素免费

时间：2026年4月6日

来源：Cancer Research

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本工作系统解析了口腔鳞状细胞癌（OSCC）中外源性DNA（ecDNA）的分子特征及功能影响，发现ecDNA阳性肿瘤显著富集于舌下区和舌部，携带CCND1、FGF19等关键致癌基因扩增，并通过增强调控元件活性导致靶基因表达量上调6倍，同时伴随免疫细胞浸润模式改变，如自然杀伤细胞减少。研究证实ecDNA是OSCC肿瘤生物学特征的重要关联因子，并提示其作为潜在治疗靶点的临床价值。

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摘要

引言：

染色体外DNA（ecDNA）是由染色体结构不稳定产生的环状染色体片段组成。在实体瘤中，ecDNA会扩增癌基因，重塑顺式调控结构，并改变治疗反应。其在HPV阴性的口腔鳞状细胞癌（OSCC）中的作用仍不明确，迄今为止只有有限的肿瘤特异性分析。阐明其对转录失调和肿瘤表型的影响可能有助于识别OSCC的致癌驱动因素。

方法：

我们评估了来自加拿大Marathon of Hope癌症中心网络（MOHCCN）的OSCC病例。对131个原发性肿瘤进行了全基因组（约80倍深度）和批量全转录组测序（约8000万个读段）。使用AmpliconArchitect和AmpliconClassifier解析了ecDNA的结构。通过DESeq2进行了差异基因表达分析，使用Cibersort进行了免疫细胞类型的去卷积分析。生成了匹配的患者来源的异种移植瘤（PDXs）以评估下游功能效应。

结果：

所有OSCC病例均接受了手术治疗，其中16%为I-II期，84%为III-IVB期。在131个肿瘤中，有33个（25.2%）检测到ecDNA。与ecDNA阴性病例相比，ecDNA阳性的肿瘤在分布上存在显著差异，尤其是在口底和舌部肿瘤中更为常见（Fisher精确p值=1.7×10^-4）。吸烟状况、饮酒史和肿瘤分期与ecDNA负担无显著关联。复发的ecDNA结构中含有关键的癌基因及其共扩增伙伴，包括CCND1、FGF19、FGF3、FGF4、MYEOV、PPFIA1、CTTN和ANO1，这些基因在11号染色体（n=14）和7号染色体（n=9）上的富集程度最高。转录组分析显示，ecDNA富集基因的表达水平显著上调，相对于非ecDNA基因高出约六倍（Wilcoxon检验，p<1×10^-16）。ecDNA拷贝数与RNA表达的相关性支持了剂量效应和调控增强；启动子样元件密度与表达呈正相关（R=0.36，p=0.046）。免疫细胞去卷积分析显示，ecDNA阳性肿瘤中的静息自然杀伤细胞数量显著减少（FDR<0.05），而M1巨噬细胞（FDR=0.065）和CD8 T细胞（FDR=0.096）也表现出类似的下降趋势。此外，还生成了88名患者的匹配PDX模型，并对其进行了转录组和蛋白质组分析；其中26/88（29.5%）的肿瘤为ecDNA阳性。

结论：

本研究阐明了ecDNA在OSCC中的存在形式及其功能影响，包括转录扩增、调控元件活性以及免疫环境的改变。这些发现将ecDNA确定为肿瘤生物学的相关因素和潜在的治疗靶点。

引用格式：

Lucas Penny, Hugh Kim, Jeffrey Bruce, Matthew Waas, Meinusha Govindarajan, Christopher Yao, Thomas Kislinger, Laurie Ailles, Scott V. Bratman. 口腔鳞状细胞癌中染色体外DNA的分子和临床相关性 [摘要]。载于：2026年美国癌症研究协会年会论文集；第一部分（常规摘要）；2026年4月17-22日；加利福尼亚州圣地亚哥。费城（PA）：AACR；Cancer Res 2026;86(7 Suppl):Abstract nr 7510。