造血干细胞循环参考模型的构建及其在血液疾病诊断中的应用

时间:2025年6月28日
来源:Nature Medicine

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本研究通过单细胞RNA测序技术分析了148名健康个体的循环CD34+造血干细胞(HSPCs),建立了首个跨年龄段的循环HSPC参考模型。研究发现男性衰老伴随显著的髓系分化倾向,并鉴定了淋巴祖细胞中与年龄相关的转录特征。该模型成功应用于骨髓增生异常综合征(MDS)的无创诊断,通过外周血样本即可识别淋巴细胞、嗜碱性粒细胞或粒细胞祖细胞频率异常的患者群体,为血液学单细胞基因组学的临床应用提供了新范式。

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血液研究的里程碑:从健康到疾病的造血干细胞图谱
造血系统衰老伴随血细胞计数的异常变化,但循环造血干细胞(HSPCs)的生理变异规律及其诊断价值长期未被阐明。传统骨髓取样具有侵入性,而外周血中HSPCs数量稀少且异质性高,亟需建立系统性的参考标准。

魏茨曼科学研究所联合多个国际团队在《Nature Medicine》发表突破性研究,通过对148名23-91岁健康人外周血CD34+细胞的单细胞RNA测序,绘制了首个跨生命周期的循环HSPC参考图谱。研究创新性地发现:(1)男性特异性衰老相关髓系分化偏倚;(2)淋巴祖细胞中LMNA等基因的年龄相关表达特征;(3)红细胞分布宽度(RDW)与克隆性造血(CH)的显著关联。更引人注目的是,该模型仅需外周血样本即可区分44例MDS患者与29例血细胞减少症患者,准确率达AUC=0.93,为血液疾病无创诊断树立新标准。

关键技术方法
研究采用10x Genomics单细胞3’转录组测序,结合分子倒置探针(MIP)技术对705个白血病相关突变位点进行深度靶向测序。通过基因型解析(Vireo/Souporcell)实现样本混样解卷积,利用Metacell-2算法构建细胞状态图谱。验证队列包含18,147例RDW异常者的靶向测序数据。

研究结果
HSPC states observed across humans in PB
• 鉴定了循环HSPCs中保守的HSC状态标志物(HLF/AVP)及分化轨迹
• 发现外周血特异性富集的BEMPs和NKTDPs群体

Interindividual variation in cHSPC state composition
• 揭示个体间HSPC亚型频率存在10倍差异(如CLP-M频率s.d.=6.8%)
• 鉴定6种组成模式,其中Class VI表现为淋巴系衰竭伴干细胞特性增强

Circulating HSPC frequencies correlate with CBCs and CH
• CLP频率降低与男性红细胞压积(HCT)负相关(P<0.02)
• 高RDW人群CH突变率显著升高(OR=1.8, P<0.002)

Age-related myeloid bias is predominantly observed in men
• >60岁男性MEBEMP/CLP比值较<50岁增加2.3倍(P<0.01)
• 女性仅在绝经后出现短暂淋巴细胞计数回升

Circulating HSPC composition abnormality in cytopenia and MDS
• 划分4类MDS亚型:Group 4.1(BEMP异常)携带最高RDW值
• CLP-E样细胞频率可预测骨髓原始细胞比例(r=0.72)

研究结论与意义
这项研究首次系统描绘了健康人循环HSPCs的生理变异谱,其价值堪比1930年代建立的血常规参考范围。发现的男性特异性衰老模式提示性激素可能调控造血微环境,而LMNA特征基因为衰老相关免疫衰退提供分子标记。临床转化方面,通过整合单细胞组学与常规血检数据建立的诊断模型,使MDS诊断灵敏度达94%,且能监测del(5q)患者的治疗反应。该资源平台(https://apps.tanaylab.com/MCV/blood_aging)将持续推动血液疾病机制研究与精准诊疗发展。

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