在脑脊液培养结果为阴性的儿科临床样本中,通过PCR检测出肺炎链球菌10A血清型的高检出率

时间:2026年1月23日
来源:Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica

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本研究旨在比较传统培养结合Quellung试验与直接PCR血清分型在脑脊液样本中检测肺炎链球菌血清型的效果。结果显示,直接PCR在阴性样本中更易检测到血清型10A,尤其在儿童中占比达36.4%(vs 6.0%)。结论是直接PCR能提高诊断准确性,尤其对PCV15疫苗未覆盖的10A型。

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Juan Carlos Sanz | Marta Pérez-Abeledo | Ana Garrido-Buenache | Susana Jiménez | Fernando Martín | Jesús Iñigo
马德里自治区公共卫生实验室,马德里自治区卫生局公共卫生总司,西班牙马德里

摘要

引言

本研究的目的是根据不同的微生物检测策略,确定脑脊液(CSF)样本中肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae,简称SP)血清型的分布情况。

方法

肺炎链球菌的鉴定和血清型分类通过常规脑脊液培养以及Quellung血清型鉴定法(CI-CS)进行。对于脑脊液培养阴性的样本,则采用直接PCR血清型鉴定法(PCR-DS)进行鉴定和分类。

结果

在2018年至2024年间,共研究了144株肺炎链球菌/脑脊液样本(31例儿童和113例成人)。血清型3、8、10A、23B、12B/12F和6C占所有样本的54.9%。在脑脊液培养阴性的样本中,通过PCR-DS检测出的血清型10A的比例为36.4%(4/11例[4例儿童]),而通过CI-CS检测出的比例为6.0%(8/133例[3例儿童];p < 0.01)。

结论

在脑脊液临床样本中直接使用PCR进行检测和血清型分类,可以补充培养-Quellung血清型鉴定法,有助于提高对由血清型10A引起的儿童肺炎链球菌性脑膜炎的诊断准确性。

引言

肺炎链球菌性脑膜炎是一种严重的侵袭性肺炎链球菌疾病,可通过接种肺炎链球菌结合疫苗(PCV)来预防。马德里自治区于2006年11月开始系统性实施PCV疫苗接种计划,将7价肺炎链球菌结合疫苗(PCV7)纳入儿童免疫程序。2010年6月,PCV7被13价肺炎链球菌结合疫苗(PCV13)取代。2012年7月PCV13从资助的免疫计划中移除,后又于2015年1月重新纳入。自2020年5月起,马德里自治区开始为儿童接种15价肺炎链球菌结合疫苗(PCV15)。2016年,PCV13开始用于成人(特定出生队列)的接种,2018年1月其接种范围扩大至所有60岁及以上的成人。2023年4月,PCV13被20价肺炎链球菌结合疫苗(PCV20)取代。1 Quellung试验是肺炎链球菌血清型鉴定的金标准,需要通过培养分离细菌并制备细菌悬液,然后与相应的抗血清进行反应。2基于分子PCR的荚膜基因分型方法是一种替代方案,可以在不进行细菌培养的情况下直接在临床样本中鉴定肺炎链球菌血清型3, 4,即使没有分离到细菌菌株也能有效应用5。 本研究的目的是根据不同的检测策略(i)培养分离后进行常规血清型鉴定(CI-CS)或(ii)对脑脊液培养阴性样本直接进行PCR血清型鉴定(PCR-DS),来确定脑脊液样本中肺炎链球菌的血清型分布情况。

方法 在马德里自治区,医院微生物学部门将分离出的肺炎链球菌菌株或脑脊液样本(对于培养阴性的样本)送至马德里自治区公共卫生实验室(MRPHL)进行表型特征分析。血清型鉴定采用乳胶凝集试验和Quellung反应(本研究采用CI-CS方法),使用特定抗血清(SSI Diagnostica A/S,丹麦Hillerød)。对于培养阴性的样本,直接在脑脊液样本上进行肺炎链球菌的鉴定和血清型分类。

结果

在2018年至2024年间,共研究了144株肺炎链球菌/脑脊液样本,涉及144例肺炎链球菌性脑膜炎病例(31例儿童和113例成人)。血清型3、8、10A、23B、12B/12F(这些血清型在血清型水平上无法区分)和6C占所有样本的54.9%。其中,血清型10A在培养阴性样本中通过PCR-DS检测出的比例为36.4%(4/11例[4例儿童]),而通过CI-CS检测出的比例为6.0%(8/133例[3例儿童];p < 0.01)。

讨论

目前已知有108种肺炎链球菌血清型7。本研究中在脑脊液样本中发现了32种不同的血清型/血清组。部分培养分离出的菌株未能被明确鉴定为特定血清型,仅被归类为相应的血清组。这是由于Quellung试验的主观性,其结果取决于操作者的判断。类似的情况也存在于PCR血清型鉴定方法中,有时无法区分所有可能的血清型4

CRediT作者贡献声明 总体概念设计和研究方案:JCS。方法学和数据分析:JCS、MP-A、AG-B。流行病学现场研究、数据收集和清理:SJ、FM、JI。实验室分析:MP-A、AG-B。初稿撰写、研究结果解读、文章撰写和编辑:JCS、MP-A、AG-B。研究结果的严格审核以及准确性和完整性的最终确认:所有作者共同完成。

伦理考量 本研究是在马德里自治区(ARM)的侵袭性肺炎链球菌疾病(IPD)流行病学监测框架下进行的,遵循了2013年修订的《赫尔辛基宣言》的相关规定。 在西班牙,根据2018年12月5日的《数据保护与数字权利保障组织法》第3/2018号法规,处理健康数据时无需获得研究伦理委员会的批准。

知情同意 本研究基于公共卫生监测中允许的法定例外情况,使用了识别数据和健康记录,无需征求参与者的个人知情同意。

关于人工智能和AI辅助技术在写作过程中的声明 本研究未使用任何人工智能技术。

资金支持 本研究未获得任何公共部门、商业机构或非营利组织的专项资助。

利益冲突 JCS曾参与并合作过由辉瑞(Pfizer)和默沙东(MSD)资助的科学会议、大会和演讲活动。其他作者声明不存在利益冲突。

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