北方管鼻鹱（Fulmarus glacialis）可为理解塑料相关毒性的“同一健康（One Health）”研究提供理想模型。塑料中含有的添加剂可发挥内分泌干扰化学物质（EDCs）作用，这类物质会浸出至环境中，常对野生动物激素信号传导产生干扰。作为生态毒理学模型，这种海鸟为在真实暴露条件下探究上述效应提供了独特机遇。目前欧盟《海洋战略框架指令》已将其用作东北大西洋海洋垃圾的被动生物指示物，判定依据为个体胃部存在显著塑料负荷的比例。本综述旨在推动将北方管鼻鹱的角色从被动指示物升级为主动哨兵物种，以更深入理解慢性塑料暴露的长期环境健康影响。该物种独特的生态位、高营养级及广域觅食行为使其特别易受塑料摄入影响，为暴露评估提供了相关模型。研究人员探讨了表观遗传机制在介导基因-环境互作中的作用，尤其是塑料暴露如何影响基因表达并导致不良健康结局。此外，基因组测序与注释技术的进步使得识别塑料来源EDCs影响的分子通路成为可能，有助于通过系统生物学表征复杂的不良结局。最后，研究人员明确了将分子与基因组分析整合到基于北方管鼻鹱的监测工作中的实际优势与方法学挑战，重点关注兼捕个体与长期研究队列。该框架支持将北方管鼻鹱作为哨兵物种，用于监测海洋生态系统中的塑料相关健康风险。
引言
塑料是高分子量聚合物，按尺寸可分为宏塑料（>25 mm）、中塑料（25–5 mm）、微塑料（5 mm–100 nm）与纳米塑料（<100 nm）。大尺寸塑料摄入可引发野生动物局部炎症、纤维化与胃肠道梗阻；微纳塑料因尺寸更小更易转运至远端组织。所有塑料均含多种添加剂与单体，其中许多属于内分泌干扰化学物质（EDCs），包括双酚A（BPA）与邻苯二甲酸酯，同时塑料在环境中还会吸附多氯联苯（PCBs）与全氟烷基物质（PFAS）等其他EDCs。这类塑料相关EDCs通过干扰基础生理过程，对人类与野生动物产生广谱系统性不良健康影响，其广谱毒性由表观遗传机制介导，最终导致发育、生殖与代谢功能障碍。鉴于塑料污染带来的普遍环境健康问题，目前全球正在谈判《全球塑料条约》。传统塑料毒性研究方法包括体外与体内模型，但难以复现真实世界中慢性暴露与适应不良的复杂性，且行业常以毒性相似的新型化学替代品规避监管限制，塑料化学混合物的异质性进一步增加了实验室暴露研究的难度。表观遗传改变通常是环境暴露导致健康影响的早期分子事件，且介导环境因素与基因组的互作，因此塑料暴露的表观遗传响应研究对环境变异性尤为敏感。传统毒理学方法的局限性使得野生物种的生态毒理学研究在反映真实塑料暴露模式、理解慢性暴露的整体适应方面具有重要价值。系统生物学通过应用计算模型分析多维数据集，为环境健康研究提供整体框架；比较基因组学可揭示进化关系、基因功能及与疾病易感性和适应性响应相关的遗传变异，二者结合可用于识别遗传多样性与适应模式，支撑保护生物学研究。海洋是塑料与相关污染物的主要汇，顶级海洋物种常作为生物指示物，大量摄入塑料碎片，针对这类物种的系统生物学研究可为理解塑料污染的生态与健康后果提供关键见解。然而，将生物指示物扩展为塑料暴露的生态毒理学模型仍面临多重障碍，多数野生物种缺乏完成基因组构建与配套注释，无法满足表观基因组、转录组与蛋白质组数据的分析需求，同时伦理考量、保护关切与后勤挑战也限制了涉及动物处死的野生物种环境研究。北方管鼻鹱长期以来被认可为东北大西洋的塑料生物指示物，通过其摄入的塑料废物被动反映塑料污染程度，但这类长寿命捕食者的塑料暴露健康影响仍未得到充分研究。本综述提出将北方管鼻鹱用作主动哨兵物种，以阐明塑料暴露的环境健康影响，该物种具备高塑料摄入倾向、生物指示物地位、长寿命、行为与解剖学特征、完整基因组构建及多样样本类型等优势，角色升级契合了从仅关注污染物存在到同时评估暴露环境健康影响的需求，填补风险评估与管理的关键空白。本综述的目标包括：探讨表观遗传机制在理解塑料相关EDCs综合健康影响中的作用；明确北方管鼻鹱适合作为哨兵物种的独特生态与生物学特征；概述将北方管鼻鹱的生态毒理学数据整合到更广泛环境健康评估中的实践考量。
塑料毒理学的系统生物学与生态毒理学方法考量
本节探讨表观遗传学在生物体响应塑料释放化学物质中的核心作用，并阐述生态毒理学与系统生物学在理解此类暴露环境健康影响中的贡献。
塑料中化学物质的生物响应中的表观遗传学作用
过去二十年，表观遗传机制在响应EDCs中的关键作用日益明确。EDCs通过模拟、阻断或改变激素及其受体的产生与转运干扰内分泌系统。表观遗传学指不伴随DNA序列改变的基因表达变化研究，其涵盖“DNA周围调控基因组活性、独立于DNA序列且有丝分裂稳定性的分子因子与过程”。这类表观遗传改变可修饰基因表达谱，可能导致细胞功能障碍与不良健康结局。内分泌系统与表观遗传机制之间存在复杂的双向关系：雌激素受体在响应塑料化学物质暴露中发挥重要作用，不同表观遗传状态在细胞分化、发育、激素响应与环境适应调节中必不可少，但外源性EDCs暴露可能导致异常表观遗传改变，偏离正常发育与健康终点。表观遗传改变可通过DNA甲基化（DNAm）、非编码RNA调控与组蛋白修饰发生，且可能长期持续。高通量测序（HTS）方法正成为解析非模式物种DNAm变化的核心工具，此类扰动研究可为揭示塑料及其EDCs干扰的调控机制提供关键见解。DNAm测序可表征DNA中甲基（-CH3）的存在与否，塑料相关EDCs诱导的DNAm异常可导致转录与生物过程失调，例如常见增塑剂邻苯二甲酸二（2-乙基己基）酯（DEHP）暴露与DNAm模式显著改变、甲基-CpG结合蛋白与DNA甲基转移酶（DNMTs）表达升高相关，进而引起转录抑制。另有研究显示DEHP暴露与关键代谢过程相关基因的差异表达相关。多项研究发现，早期发育阶段（对发育更敏感）的负面效应常导致成体繁殖成功率与生存率下降。值得注意的是，部分经减数分裂持续的表观遗传修饰可通过生殖系跨代传递，这意味着EDC相关的表观遗传改变可能传递给未直接接触污染物的后代，考虑到塑料的抗生物降解特性，这类慢性效应尤其值得关注。
生态毒理学与系统生物学在捕捉生物响应复杂性中的作用
表观遗传状态的高度情境依赖性使其成为连接EDCs环境暴露与基因表达变化的关键中介。尽管现有EDC效应模型已取得进展，体外细胞模型无法复现EDCs诱导的系统性效应，临床前体内对照研究多采用啮齿类模型，但实验室环境本身可诱导表观遗传改变与特异性不良健康效应，使得对环境敏感状态及其改变的研究存在挑战。在野生动物不当暴露于管理不善的塑料废物的背景下，塑料毒理学生态模型应运而生。自然实验组可按时间或地理差异分为不同塑料与EDCs暴露水平的群体，这类开放体内系统为实验室动物测试提供了有前景的替代方案。开放系统存在大量相互作用变量，直接建立因果关系存在难度，但可通过效应规模、可重复性、时间序列与梯度效应评估因果性。野外喂养研究也可提供补充证据，但可能面临伦理障碍。野外研究对于在生态与进化相关场景中理解暴露的后果与机制至关重要，这类场景中环境变量波动、资源有限，面临强烈自然选择。例如尼罗鳄研究发现，环境胁迫期与有机氯生物富集带来的毒理学风险升高相关；黑腿三趾鸥中PFAS与PCBs暴露与翻卵行为改变相关，PCBs暴露与涉禽蛋壳变薄相关；中华白海豚种群层面的EDCs影响中，烷基酚是最突出的新兴关注污染物。这些结果均表明生态毒理学研究在理解塑料及其EDCs暴露健康影响方面的重要价值。
塑料与EDC生态毒理学中的哨兵物种作用
生物指示物或生物监测物种在评估污染水平中发挥被动作用，而哨兵物种则主动评估污染影响，二者常被混用。生物指示物追踪环境变化、评估管理措施有效性，并作为生态转变的早期预警系统。过去30年陆生与水生鸟类生物指示物研究显示，塑料相关化合物（如EDCs）正威胁鸟类生存，但这类暴露对生物指示物的健康影响尚未得到充分关注。相比之下，哨兵物种凭借其生态位、栖息地和行为可提供风险与危害的提前预警，其可测量的危害响应可被用于推断对人类与其他物种的风险。历史上最早的哨兵物种案例是煤矿中使用的金丝雀，因其体型小、呼吸快，对一氧化碳高度敏感，若金丝雀从栖木坠落即可为矿工提供一氧化碳危害预警。其他案例包括宠物犬作为环境化学物质影响生育力的哨兵、鱼鹰作为湖泊水库河流与河口环境污染物的哨兵、鱼类作为巴西水库与加州沿海环境污染的哨兵，以及密西西比短吻鳄作为湿地生态系统顶级捕食者，可生物富集污染物，其完善的生理学特征与污染物易感性使研究者可检测基线健康的偏离并评估更广泛的生态影响。鉴于广域海洋鸟类常被用作环境塑料污染的生物指示物，现有数据支持借鉴爬行类研究思路，利用鸟类模型探索塑料摄入的生物响应。
作为塑料暴露环境健康影响评估哨兵种群的野生鸟类
所有脊椎动物均具有复杂的内分泌系统，通过下丘脑-垂体-甲状腺（HPT）轴与下丘脑-垂体-肾上腺（HPA）轴维持稳态，但鸟类因飞行所需的代谢能与氧需求，具有高代谢率与相对复杂的社会系统，这一代价可能使EDCs的健康标志物效应更易显现。海鸟生活史属于K选择型，即长寿命、低繁殖率、后代生长缓慢，根据生活史理论，个体某一阶段的适合度受前一阶段事件的影响，因此对慢性毒物暴露的累积效应更敏感。目前量化海鸟组织中塑料相关EDCs的研究多聚焦于多溴二苯醚（PBDEs）等传统污染物，针对塑料来源EDCs的研究较少，多数研究通过死亡鸟类（兼捕与搁浅个体）获取消化道塑料数据，但死亡时的胃内容物无法完全反映长期EDC暴露模式，存在“快照”局限。近期研究开始采用微创方法测量活鸟塑料与EDCs暴露，例如测定尾脂腺中邻苯二甲酸酯水平，可实现动态时序监测。鸟类响应塑料来源EDCs的表观遗传适应研究仍十分有限，现有证据显示鸟类母体暴露可改变后代DNA甲基化模式，且早期暴露对DNA甲基化的影响可贯穿终身，甚至存在跨代遗传现象。EDCs发挥毒性的生物通路在物种间高度保守，部分源于疾病相关基因与通路的保守性，这提升了生态毒理学发现对更广泛环境健康的适用性与相关性。比较基因组学可利用近缘模式物种的直系同源基因序列，在无详细基因组注释的非模式物种（如多数野生鸟类）中识别转录本。不良结局通路（AOP）框架为理解化学暴露到不良效应的具体生物事件提供了结构化路径，可用于设计更有效的采样方案，通过关联塑料暴露与特异性生物响应，靶向通路中的关键事件（KEs），优先选择肠道损伤、氧化应激、内分泌干扰、免疫变化与颗粒转运等相关生物标志物，指导粪便、血液、羽毛与微生物组等合适组织或基质的选择。通过将采样与生物敏感期（如繁殖、育雏、换羽）对齐，纳入重复测量与分子端点，可减少“快照”采样的局限，更好地捕捉时间模式。对同一只个体的颗粒指标与生物标志物进行配对分析，并在多个KEs中应用证据权重标准，可增强塑料影响推断的可信度。实践中可采用标记个体的季节性采样、非致死采样与标准化颗粒评估，长期追踪暴露与生物效应，从而改进对塑料污染健康与生态风险的预测与理解，支撑监管决策与风险评估。
北方管鼻鹱的特征及其作为塑料暴露系统生物学哨兵的实用性
前文讨论了塑料化学暴露的生物后果与哨兵物种的作用，本节聚焦北方管鼻鹱在该领域的潜力。自2002年起，奥斯陆-巴黎公约（OSPAR）与欧盟《海洋战略框架指令》（MSFD）将兼捕与搁浅北方管鼻鹱的胃内容物用作北海塑料污染的生物监测工具，后推广至东北大西洋。其生物监测能力源于胃内塑料含量可代表其海洋觅食区域的塑料污染水平。以下从生物指示物历史、特征与生物学属性、分布、繁殖生态学、行为、保护状况及塑料互作等方面展开分析，总结近期表征北方管鼻鹱塑料摄入与EDC生物富集的研究进展。
北方管鼻鹱作为海洋塑料污染生物指示物的历史
1972年多个政府与欧盟共同成立OSPAR，以持续评估东北大西洋海洋环境。在van Franeker等的试点研究后，OSPAR认可搁浅北方管鼻鹱的胃内容物是东北大西洋区域海洋塑料水平的可靠敏感监测工具，且研究发现搁浅死亡个体的胃塑料含量与同期活体鸟类无显著差异。基于该工具的成效，OSPAR实施了可量化的OSPAR生态质量目标（EcoQO），规定超过10%的搁浅北方管鼻鹱胃塑料含量高于0.1 g即视为未达标。近期应《海洋战略框架指令》要求，EcoQO被“北方管鼻鹱阈值（Fulmar-TV）”取代，沿用相同方法与目标定义，但目前东北大西洋所有区域仍未达标。地理格局显示，高北极加拿大等原始区域Fulmar-TV%为10%，而低纬度如加利福尼亚达86%，这类差异可能与输送塑料垃圾的洋流有关。由于管鼻鹱所属的鹱形目具有共有特征，其他鹱类（如海燕、信天翁、 shearwaters）也被提议作为全球塑料生物指示物。
北方管鼻鹱用于海洋塑料生物监测的特征
北方管鼻鹱的多个特征使其适用于海洋塑料生物监测：其仅在海上觅食（区别于鸥科），且解剖结构使塑料滞留于胃中，可反映其即时海洋环境的位点 fidelity 与垃圾污染水平。其表层觅食行为、在北极与寒带海域的广泛分布，以及塑料的长滞留时间，使得胃内容物可在广阔地理区域与时间尺度上全面反映环境条件。这些生物监测特征与其长寿命等属性结合，使其成为塑料及其相关化学物质不良环境健康影响的理想哨兵。
解剖学与胃肠特征
北方管鼻鹱是丰富的广食性海鸟，体长45–50 cm，翼展约110 cm，平均体重767 g，雌雄同型，体色从白色到深灰色不等，“管鼻”特征与僵硬的振翅飞行模式使其易被识别。其胃分为两部分：前胃负责食物储存与消化起始，肌胃更小且肌肉发达，负责研磨坚硬食物后再进入肠道。胃与肠之间的幽门括约肌狭窄且角度尖锐，可长时间滞留塑料。此外，与其他鸟类相比，北方管鼻鹱不会频繁反刍难消化猎物，使得塑料在肌胃的滞留时间可达2–3周，增加了EDCs从塑料中浸出与后续生物富集的可能。半野外喂养研究证实，海鸟摄入海洋塑料可直接导致高水平的塑料相关EDC积累，且北方管鼻鹱的胃油可促进摄入塑料中EDCs的浸出。亲鸟常通过反刍将摄入的塑料喂给雏鸟，导致繁殖季成体塑料积累下降，同时雏鸟在发育敏感窗口暴露于更高负荷的塑料与化学物质，年轻个体塑料摄入量更高。
分布、繁殖与觅食生态学
北方管鼻鹱为单配制，营群居生活，每年仅产1枚卵，可在夏季繁殖群对活体进行年度采样，同步获取健康指标、存活率与繁殖参数。其广泛分布于北半球北极与寒带区域，在北极、欧洲、北美与亚洲的悬崖上繁殖，250年前温带区域种群稀少，向南扩散至英国、爱尔兰甚至法国，被认为与商业渔业丢弃的鱼与内脏可用性增加有关。非繁殖季（9月至次年3月）北方管鼻鹱主要在海上活动，历史上海上活动特征较难表征，其作为表层觅食者，利用开阔海洋与远洋觅食区，食物包括中上层鱼类、鱿鱼与磷虾、端足类等浮游动物。北方管鼻鹱处于高营养级，加之摄入富含EDCs的海洋塑料，且偏好脂肪含量高的猎物或猎物脂肪部位（如内脏油、水母生殖腺组织，是疏水性EDCs的富集区域），因此暴露于高水平的EDCs，浓度范围从亚μg/kg到mg/kg级。高暴露水平、北极与寒带海域的长寿命，使得该物种可能出现显著的生物响应。
行为
北方管鼻鹱是海洋大型动物中海洋塑料摄入量最高的类群之一，摄入尺寸涵盖微塑料到中塑料，荷兰长期研究显示自1980年以来摄入塑料颗粒的平均质量下降，呈小型化、数量增多趋势，目前纳米塑料范围尚未开展研究。增加其塑料摄入倾向的行为因素包括：表层觅食习性与聚乙烯（PE）、聚丙烯（PP）等正浮力塑料碎片的分布区域重叠，这类塑料是海洋环境中最常见的聚合物，易在洋流形成的涡旋中聚集，成为塑料污染热点。PE比其他塑料聚合物更易结合有机污染物，且南北半球海洋垃圾交换有限，北半球人口更多，全球大部分海洋垃圾在此累积，与北方管鼻鹱的分布区重合。
保护状况
北方管鼻鹱平均寿命35年，通常9岁左右开始繁殖，长寿命使得塑料暴露可诱导表观遗传改变的累积。作为K策略繁殖物种，种群从衰退中恢复缓慢。1984年至2008年爱尔兰与苏格兰等区域的种群因繁殖概率下降与成体存活率降低出现衰退，东北大西洋繁殖种群总体下降40%，原因尚未完全明确，可能与商业渔业导致的猎物可用性下降、兼捕、人为胁迫互作及海表温度变化等大规模过程相关。该物种目前全球种群约2000万只，未处于全球受威胁状态，但在欧洲被列为易危，在爱尔兰被列为2020–2026年“受关注鸟类”，凸显了理解其塑料暴露与健康效应的紧迫性。
北方管鼻鹱塑料摄入与EDC生物富集模式的表征
Fulmar-TV%是OSPAR与欧盟MSFD监测方法的核心指标，指胃塑料含量超过0.1 g的个体占比，政策目标为降至10%以下。近期北太平洋数据显示，东北大西洋受塑料污染最严重的区域位于较低纬度，与洋流相关，该规律已被其他海洋污染监测研究证实。需注意，死亡时的胃塑料含量不一定反映长期暴露模式，这对作为长期过程的EDC生物富集尤为重要。北方管鼻鹱倾向于保持固定的越冬地点，意味着部分个体若在污染更重的区域觅食，可能获得更高的终生暴露量。胃内容物中PE与PP占比最高，聚氯乙烯、聚苯乙烯与其他塑料也较常见，来源涵盖消费与工业领域，形状包括薄片、线、泡沫、碎片等。摄入情况存在年龄与性别差异：年轻个体塑料摄入率更高，雌性摄入率显著高于雄性（但区域一致性较弱）。积极进展是2009年至2018年北海北方管鼻鹱胃塑料含量显著下降，被认为是塑料管理意识提升与管控措施的结果，但Fulmar-TV在东北大西洋所有区域仍未达标。关于北方管鼻鹱塑料摄入与体内污染物负荷的关联，研究结果尚不一致：加拿大北方管鼻鹱塑料暴露未伴随肝PCB负荷升高，挪威研究认为塑料更像是环境污染物的被动采样器，塑料与组织PCB谱相似；但短尾鹱研究显示塑料摄入与特定低氯PCB同系物呈正相关。现有研究在靶组织、化合物与单位上存在高度异质性，且多聚焦于持久性有机污染物（POPs）的积累，对其他塑料相关EDCs（如PFAS、邻苯二甲酸酯、烷基酚）的表征不足，近期研究显示多种塑料相关化学物质可在北方管鼻鹱组织中检出，但塑料负荷与浓度通常无显著关联，凸显了该物种化学暴露通路的复杂性，亟需填补新兴污染物积累的认知空白。
北方管鼻鹱中塑料及其化学物质的不良健康效应证据
尽管塑料相关EDC生物富集与摄入的关联复杂，但已有明确迹象表明塑料暴露与北方管鼻鹱的不良健康效应相关。2004年曾出现成体雌鸟异常死亡事件，原因是冬季食物长期短缺导致身体状况恶化，血液中污染物（包括塑料化学物质）循环水平升高，携带成熟卵的雌鸟死亡，提示存在内分泌或激素紊乱（健康不佳的鸟类通常不繁殖）。近期鹱形目搁浅个体尸检显示，北方管鼻鹱消化道肿瘤（组织异常过度生长）发生率高于其他海鸟，消瘦是主要死因，可能源于高塑料摄入引发的虚假饱腹感。另有研究显示身体状况显著影响PBDE水平，搁浅鸟类的PBDE水平高于兼捕个体。体外分析证实，BPA、BPS、4-OP、PBDEs与PCBs均可激活北方管鼻鹱与人类雌激素受体（ESR1与ESR2），表明该物种对不同物种塑料相关化学物质的响应具有相似性，支持其作为哨兵物种的潜力，但仍需进一步评估其对其他海洋物种响应的相似性。此外，部分北方管鼻鹱胃塑料内容物产生的化学浸出液对雌激素受体表现出多样化效应，凸显了塑料中复杂化学混合物在毒性中的重要性，进一步强调了生态毒理学方法在塑料毒理学中的价值。
将北方管鼻鹱用作系统性塑料毒性哨兵的实践考量
系统生物学方法有助于理解塑料相关暴露与生物富集的分子与基因组影响，依托大数据方法分析基因调控与表达变化，识别关键生物通路与细胞信号系统的扰动。转录组与DNAm测序需要高质量的核酸保存与完善的基因组注释，以实现生物信息学层面的精准基因识别。牛津纳米孔测序可通过检测DNA穿过纳米孔时的碱基特异性电信号偏移直接检测DNA甲基化，无需亚硫酸氢盐转化，实现长读长、单分子甲基化分析，尤其适用于解析重复区域、单倍型与大基因组背景下的甲基化模式。环境样本常面临核酸降解的挑战，尤其是RNA因单链结构更易受酶解与化学降解，温度波动、核酸酶暴露与环境污染物污染会加速RNA降解，因此需要严格的采集与保存流程以保障分子分析的样本质量。系统生物学模型中，整合常规健康生物指示物可大幅提升对生物体环境胁迫响应的理解：羽毛组织的激素筛查工具可检测与应激响应、繁殖健康、代谢过程相关的激素水平；代谢组学分析可反映环境变化的即时响应；微生物组分析可揭示外部环境变化对内部微生物生态系统的影响；蛋白质组学可追踪适应与应激响应中的蛋白质表达与修饰；遗传与表观遗传标志物可反映环境压力诱导的长期适应与可遗传改变；免疫系统标志物（如特异性抗体水平）可直接指示病原体暴露或胁迫；氧化应激标志物（如抗氧化剂与氧化损伤生物标志物）可反映生理胁迫水平，评估环境毒素的影响。这些生物指示物共同构成综合工具包，助力研究者解析复杂生物响应，支撑物种对未来环境场景响应的预测，服务于保护努力与生态管理。
北方管鼻鹱系统生物学研究程序考量
北方管鼻鹱等鸟类的系统开学生态毒理学研究的程序考量需要谨慎规划与遵循特定协议，以保障数据完整性与可靠性。选定具备测序基因组、合适暴露特征与属性的物种后，需优先考虑伦理问题，所有研究活动需获得相关野生动物与伦理审查委员会的批准，最小化对鸟类的胁迫与伤害。采样方法（尤其是羽毛、血液或组织采集）应尽可能采用无创或微创方式，避免影响鸟类健康或胁迫水平。处理鸟类时，操作人员需接受规范的捕获与保定培训，保障动物安全并降低胁迫。样本的保存与处理（尤其是易快速降解的RNA）需在受控条件下快速完成，维持样本质量。分析方法（基因组学、蛋白质组学或代谢组学）需与研究目标及目标鸟类的特征对齐。最后，数据整合与分析需考虑生物系统内的复杂互作，采用稳健的统计与计算模型从多组学数据集中推导有意义的见解，这些程序考量是扩展塑料生物指示物为哨兵物种的核心。
基因组完整性：组装与注释
基因注释是为测序基因组中的基因分配位置与功能的过程。禽类系统发育基因组学项目组装了涵盖多数鸟类目级的48个物种的基因组数据，是迄今最大的脊椎动物系统发育基因组学项目，提供了禽类进化的关键见解。在此之前，注释的禽类基因组主要限于家鸡、火鸡与斑马雀，限制了其他鸟类的基因组研究。研究人员已成功完成北方管鼻鹱（Fulmarus glacialis）的基因组测序与组装，DNA提取自丹麦自然历史博物馆的凭证雄性样本（#137838），采用Illumina短读长技术测序，深度约33X，使用北京基因组研究所开发的SOAP de novo组装工具完成组装。De novo基因组组装指无需参考基因组即可重构生物体完整基因组。Contig N50与Scaffold N50是评估DNA序列组装质量的指标：Contig N50是长度最短
