一个中国中度高甘油三酯血症家系中罕见杂合APOA5变异体的分子特征

时间:2026年6月2日
来源:Frontiers in Genetics

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背景:高甘油三酯血症(HTG)的发生可归因于单基因或多基因病因基础,而对这种分子基础的理解尚不完整。APOA5在甘油三酯(TG)代谢中起关键作用,APOA5缺乏是HTG的一个公认病因。然而,仅在孤立病例中观察到的罕见APOA5变异体的效应通常难以确定。本研究旨

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背景:高甘油三酯血症(HTG)的发生可归因于单基因或多基因病因基础,而对这种分子基础的理解尚不完整。APOA5在甘油三酯(TG)代谢中起关键作用,APOA5缺乏是HTG的一个公认病因。然而,仅在孤立病例中观察到的罕见APOA5变异体的效应通常难以确定。本研究旨在寻找一个中国中度HTG家系的遗传病因,并进行初步的计算机模拟验证。
方法:8名家系成员接受了生化检测和基于全外显子组测序(WES)的基因检测。记录了基本信息,包括身体质量指数(BMI)、病史、TG管理处方以及吸烟和饮酒习惯。进行了全面的残基保守性分析和蛋白质结构稳定性的计算模拟,以评估假设的致病变异体的影响。
结果:鉴定出一个罕见的杂合APOA5变异体(p.R223C)。具体而言,携带该变异体的6名家系成员的空腹血浆TG水平显著高于公认阈值(1.7 mmol/L),最高达4.96 mmol/L,而该家系中一名非携带者的TG正常。p.R223C变异体在ClinVar和gnomAD数据库中不存在。此外,计算机模拟预测结果支持该变异体的潜在有害性。
结论:本研究提出了一个与罕见APOA5变异体相关的家族性中度HTG病例,根据ACMG/AMP指南,该变异体被分类为很可能致病(LP)。该变异体的真实效应需要通过生化或细胞研究进一步验证。
高甘油三酯血症(hypertriglyceridemia, HTG)以血液中甘油三酯(triglyceride, TG)水平升高(>1.7 mmol/L)为特征,影响全球约10%成人,并与动脉粥样硬化性心血管疾病、胰腺炎及代谢紊乱相关。HTG的发病涉及单基因或多基因病因,但目前对该分子基础的理解尚不完整。APOA5(载脂蛋白A5)是一种主要由肝脏合成的小分子载脂蛋白,通过增强脂蛋白脂肪酶(lipoprotein lipase, LPL)活性促进富含TG的脂蛋白(如乳糜微粒和极低密度脂蛋白)中TG的水解,因此是血浆TG水平的关键调节因子。APOA5缺乏是HTG的已知原因,但仅在孤立病例中观察到的罕见APOA5变异体(如p.R223C)的致病性往往难以确定。本研究报道了一个中国8人HTG家系,其中7人携带罕见杂合APOA5变异体(p.R223C),6人(排除长期服药者)均表现为中度HTG。研究人员通过全外显子组测序(whole-exome sequencing, WES)和Sanger测序鉴定该变异体,结合生物信息学预测(残基保守性分析及蛋白质结构稳定性模拟)评估其潜在危害性,并依据ACMG/AMP指南将其分类为很可能致病(likely pathogenic, LP)。该研究为罕见APOA5变异体在家族性HTG中的作用提供了家系证据,对HTG的分子诊断和机制研究具有参考意义。论文发表在《Frontiers in Genetics》。

研究人员采用了以下关键技术方法:研究对象为来自吉首大学第一附属医院的8名HTG家系成员(含先证者及其亲属)。主要方法包括:生化检测(测定血脂、肝肾功能等指标)、全外显子组测序(WES)及Sanger测序验证;对APOA5蛋白序列(来自50个物种,含30种哺乳动物)进行多重序列比对(ClustalW/MEGA12)以评估第223位精氨酸的保守性;利用Dynamut2计算吉布斯自由能变化(ΔΔG)预测p.R223C变异对蛋白质结构稳定性的影响,并通过AlphaFold 3预测突变体结构进行比对。

研究结果如下:

**HTG家系概述**:先证者(P2)于2001年(56岁)首次检出TG升高,其后其妹(P1)及子女(P3、P4)先后诊断,2024年孙子(P8)体检发现TG异常(最高4.96 mmol/L)。所有家系成员否认糖尿病、冠心病、胰腺炎等病史;P2、P6有高血压,P3、P4有轻度脂肪肝,部分成员超重、有吸烟饮酒史。P1和P3服用阿托伐他汀,P2长期服用非诺贝特。

**生化和基因检测结果**:生化检测显示,除长期服药后TG正常的P2(但eGFR降低)和未携带变异体的P6外,其余6名携带p.R223C变异体的成员空腹血浆TG均>1.7 mmol/L(最高4.96 mmol/L),并伴有不同程度的TC、HDL-C、LDL-C及载脂蛋白E(APOE)异常。WES及Sanger测序鉴定出罕见杂合APOA5变异体(c.667C>T, p.R223C),该变异体位于APOA5最后一个外显子(第4外显子),在ClinVar和gnomAD中不存在,但在两项独立研究(Jin et al., 2018; Liu et al., 2024)中曾报道可能与HTG相关。多种计算机预测工具(SIFT、PolyPhen-2、MutationTaster)支持其有害性,REVEL评分为0.702。依据ACMG/AMP指南(PP1_Moderate + PM2 + PS4_Supporting + PP3),该变异体被分类为LP。在15个TG相关基因面板中未发现其他致病性的罕见变异,但受影响的6个个体均携带1~2个中国人群中已知的HTG风险变异(如GCKR c.1337T>C, APOA5 c.-3A>G, rs2075291)。

**APOA5第223位残基保守性分析**:对30种哺乳动物、10种鸟、5种爬行动物及5种两栖动物的APOA5蛋白序列进行多重序列比对,发现第223位精氨酸(R)在全部30种哺乳动物中严格保守,构成高度保守的七肽基序(RLSRCVQ),提示该残基对蛋白质结构和功能至关重要。

**p.R223C对APOA5结构稳定性的影响**:通过Dynamut2计算,p.R223C突变导致与邻近残基(Q313、D346、D350)的氢键和范德华力丢失,同时消除带正电的精氨酸与D346/D350之间的离子键(盐桥),并破坏部分极性接触网络。预测ΔΔG = −0.61 kcal/mol(<0),支持该变异体降低APOA5结构稳定性。

**ClinVar中短胚系APOA5变异体的汇总**:截至撰稿时,ClinVar共收录15个短胚系APOA5变异体(<50 bp),包括本研究提交的p.R223C。除两个条件未提供外,其余均与心血管表型(HTG、高脂蛋白血症等)相关,且均为致病或很可能致病。p.R223C是其中唯一的错义变异,其余为移码或无义变异(导致提前终止)。

讨论部分总结:APOA5通过结合血管生成素样蛋白3/8复合物(ANGPTL3/8)抑制其抑制LPL的能力,从而降低TG;p.R223C位于羧基端,可能影响APOA5-ANGPTL3/8结合,但目前缺乏复合物结构数据;预测结构可靠性需谨慎对待。研究局限性包括:P2和P6未行WES(但Sanger测序足以支持结论);P8的极高TG可能由p.R223C、两个共存的HTG风险变异(rs2075291和rs1260326)及生活方式(吸烟、饮酒)共同导致;p.R223C单独致HTG的程度需体外/体内功能研究确认。此外,文献发现多个APOA5风险变异(如rs662799、rs651821、rs2266788、rs2075291)具有人群特异性;p.R223C在中国汉族人群中等位基因频率极低(PGG.Han数据库0.007%),但目前报道尚不足以确定其人群特异性。临床方面,P2长期服用非诺贝特但eGFR提示慢性肾病人群风险,需调整用药;其他成员未接受降脂治疗,目前均接受饮食治疗。

结论翻译:仅基于孤立病例推断新的HTG相关变异体对临床可靠性构成挑战。在本研究中,7名HTG患者以杂合方式携带罕见APOA5变异体p.R223C,而该家系中另一名非携带者的血浆TG正常。这种基因型与表型在家系内的关联提供了有价值的证据,支持p.R223C变异体在中度HTG中的潜在有害性,为APOA5缺乏所致HTG的分子诊断和机制研究提供了见解。

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